El Movimiento Negro Francisco Congo cuenta con ejes regionales consolidados en el Norte (base de Yapatera), Centro (base de Lima), y Sur (base de Ica), a partir de los cuales se articula a otras bases, construyendo y afirmando su identidad afroperuana mediante la recuperación, recopilación, recreación y reelaboración de sus diversas expresiones culturales, desarrollando conjuntamente las capacidades organizativas e identificando y ejecutando acciones de acuerdo a planes estratégicos.