En un principio nuestras actividades se centraron en el rescate y revalorización de la cultura afroperuana. Fruto de esta labor de investigación fué el Son de Los Diablos, tradicional danza que los negros durante la colonia escenificaban para las fiestas de Carnaval y de la cual quedaban vagos recuerdos y documentos históricos. Esta danza se convirtió en el sello inconfundible de nuestra institución y pasó a ser el núcleo de organización a nivel de jóvenes, quienes realizaban presentaciones periódicas.

Debido a nuestro trabajo y a las organizaciones de base que han hecho suya las propuestas del Movimiento, poco a poco nos hemos ido constituyendo en un referente organizativo y de la cultura e historia negra. Por ello y como fruto del contacto permanente con las comunidades negras a través de talleres, seminarios y actividades de diversa índole, decidimos ampliar nuestra líneas de trabajo.

Un hito decisivo en nuestro desarrollo institucional fué la organización y gestión del 1er. Encuentro de Comunidades Negras llevado a cabo en Huampaní (Lima) en el año 1992, con la participación de los representantes de las comunidades; en donde cada uno expuso la situación en la que se encontraba sus pueblos, quedando como principal objetivo buscar la organización al interior de todas las comunidades en donde hubiera presencia negra.

Esto marcó el inicio de una nueva etapa del Movimiento , se fueron constituyendo más filiales del Movimiento Negro Francisco Congo partiendo de la propia iniciativa de los pobladores con el compromiso de trabajar en función del desarrollo de su comunidad.

La institución asumió el reto de ampliar sus líneas de acción, buscando de manera participativa las soluciones a los problemas que existían al interior de las comunidades.