El Secretario General apoya a la Directora del Plantel en la realización de sus funciones y programas de trabajo, supervisa a las demás Secretarías. Coordina todos los asuntos relacionados con la seguridad y protección civil del Plantel. Coordina y da seguimiento a las votaciones de Consejeros Universitarios, Consejeros Académicos de Bachillerato, Consejeros Técnicos e Internos del Plantel.
Representa al Director del Plantel en los eventos que determine. Atiende las actividades políticas y de información del Plantel. Coordina la elaboración del Plan Anual de Trabajo del Plantel y el Informe Anual de Actividades. La Secretaría General está a cargo del Mat. Víctor M. Martínez Gallardo.
