Com a destruição das florestas, escasseia o alimento de algumas espécies, sendo problema ainda maior nas áreas mais urbanizadas, onde são reduzidos o número de árvores. Espera-se, então, que em certos momentos os frutos tornem-se raros. Como é costume o armazenamento de frutas na cozinha ou na área de serviço, é freqüentemente observada visita de morcegos frugívoros. Nem sempre o morcego é observado pelos moradores, no entanto, as marcas e fezes deixadas pelo animal, facilmente o identifica. Para evitar este problema, a solução mais simples é o armazenamento destes frutos no interior da geladeira, evitando que o morcego os localizem pelo odor. É possível que o morcego continue visitando até que encontre outra fonte de alimento.

Em áreas urbanizadas, ocorrem espécies nectarívoras, isto é, que nutrem-se dos néctar secretado pelas flores, de maneira similar aos beija-flores. Este morcego é extremamente importante para a reprodução de numerosas plantas, como o agave, unha-de-vaca, maracujá-da-praia, entre outras, complementando sua dieta com frutas e insetos. Como as aves, durante o dia, este morcego também é atraído pela solução açucarada oferecida aos beija-flores e acostuma-se em curto período a visitar as residências que a oferecem. Apesar de inofensiva, para evitar esta visita, o método mais simples é o recolhimento dos bebedouros antes do crepúsculo.

Na cidade do Rio de Janeiro, é grande o número de árvores utilizadas no paisagismo urbano. Quando frutificam, estas árvores são visitadas por um número considerável de animais, principalmente as aves de dia e os morcegos à noite. É o caso das figueiras, bananeiras, embaúbas, jameleiros, goiabeiras, mamoeiros, sapotizeiros, cajazeiros, oitizeiros, amendoeiras-da-praia, etc. As residências próximas recebem, eventualmente, alguns morcegos desorientados.

Existem árvores que apresentam curto período de frutificação e outras com período mais longos, chegando a produzir frutos durante o ano todo. No primeiro caso, nota-se o incremento do número de encontros com morcegos em certas épocas do ano, problema que se soluciona após curto período.

No segundo, a solução mais viável é o fechamento do acesso. É importante lembrar que o extermínio dos morcegos nada resolverá, pois outros continuarão a visitar a árvore. Várias vezes ouvimos de moradores incomodados, que o uso de telas de nylon (tipo mosquiteiro) resultaria em perda de iluminação, além de ser método oneroso se a área for extensa. Método mais barato, que não impede a luz nem o vento, é a utilização de redes de nylon para pesca.

Os morcegos frugívoros visitam várias árvores a cada noite, percorrendo extensas áreas nas primeiras horas após o crepúsculo. A cada visita arrancam da árvore o fruto (ou parte deste) e o carregam para outro local, onde irão ingeri-lo. Evitam com isso predadores que também possam ser atraídos por frutas, como os gambás, e a interferência de outros morcegos. Para a ingestão dos frutos os morcegos escolhem locais calmos, pouco distante da árvore em frutificação. Por vezes detectamos o uso de parte da residência para isso, evidenciado pelo acúmulo de fezes, restos de fruto ou sementes. Os morcegos evitam lugares iluminados ou com ruídos. Na grande maioria dos casos, podemos evitá-los mantendo a luz acessa ou ligando um rádio por alguns dias consecutivos. Os morcegos apresentam estritamente atividade noturna, geralmente iniciando seus vôos durante o crepúsculo. Necessitam durante o dia repousar em locais calmos. Vários locais de residências humanas podem ser utilizados para tal fim, além das árvores do quintal. Em locais próximos a estes refúgios podem ser observadas entradas eventuais de morcegos. Para evitar esse inconveniente pode-se impedir a entrada com telas de nylon ou redes. Caso seja necessária a remoção dos morcegos refugiados, método pouco oneroso é utilizar-se bandeirolas de plástico amarradas a pequeno intervalo em cordel cercando todo refúgio. Na grande maioria das vezes os morcegos mudam-se devido à dificuldade de deslocar-se entre as bandeirolas.