Os três objetos preciosos das trevas: a bola Gaki, o espelho das trevas e a espada Kuoma são roubados por Goki, Hiei e Kurama. Yusuke mata Goki com a sua mais nova arma o Leigan. Kurama marca um encontro com Yusuke em um hospital onde conta a Yusuke que vai usar o espelho das trevas para salvar a vida de sua mãe que esta doente. Depois de salvá-la ele devolve o espelho a Yusuke. O outro tesouro esta com Hiei, que possui um terceiro olho chamado JAGAN.Hiei sequestra Keiko e assim poder lutar com Yusuke e pegar os outros dois objetos. Quando Yusuke encontra os dois, ele ve Keiko com um corte na testa. Hiei a cortou com a espada Kuoma, assim o terceiro olho irá crescer na testa dela. Os dois lutam, e Yusuke acaba vencendo após errar um golpe, ele venceu porque o seu Leigan atingu o espelho das trevas. Foi um golpe de sorte! Assim os três tesouros são recuperados, e Koenma só recebe 100 palmadas no bumbum do Rei Enma,porque o espelho estava quebrado e a espada enferrujada. A Doutrina de Genkai Botan fala para Yusuke que ele tem que participar do torneio para adquirir a doutrina de Genkai, uma velhinha,mas muito poderosa que decidiu escolher o seu sucessor através desse torneio. Yusuke tentará impedir que o temível Lando, um ladrão que já roubou 99 doutrinas. Os quatro finalistas do torneio são Shorin, Kazemaru, Kuwabara (o ex-inimigo, mas agora o melhor amigo de Yusuke) e Yusuke. A primeira luta é entre Kazemaru e Yusuke que acaba vencendo quando cai em um buraco escapando do golpe de Kazemaru que é atingido pelo próprio golpe. A segunda luta é entre Shorin e Kuwabara. A luta começa com a vantagem de Kuwabara, mas depois Shorin ataca Kuwabara com um golpe que encolhe o amigo de Yusuke, e depois Shorin quebra todos os ossos de Kuwabara que cai desacordado no chão. A final do torneio é entre Shorin e Yusuke. Botan e Yusuke descobrem que Shorin na verdade é o ladrão Lando que eles estavam procurando. Com raiva de Lando, a energia de Yusuke começa a aumentar.Yusuke consegue dar uns socos em Shorin, e depois usou o contra ataque de Shorin para joga-lo no chão.Isso faz com que Shorin assuma a forma de Lando. Yusuke é amarrado em uma árvore, debaixo da árvore, Lando coloca seus peixes monstros que adoram carne humana. Lando ataca Yusuke com o LeiGan, Yusuke cai dentro do lago. Lando comemora a vitória, mas de repente Yusuke sai da água depois que o espírito de Kuwabara o provoca. Os dois atiram o Leigan ao mesmo. Lando é atingido e jogado na água. Quando sai da água, Lando soca Yusuke, que cai no chão. Lando decide usar o golpe de encolhimento em Yusuke, só que quem encolheu foi o próprio Lando. Genkai explica que para o golpe funcionar a pessoa que for ser atingida tem que estar ouvindo a prece, mas Yusuke percebe que o seu ouvindo esta cheio de lama, por isso que ele não conseguia ouvir nada. No final,Yusuke se torna sucessor de Genkai.

Depois de ser treinado por Genkai,Yusuke reencontra Keiko e Kuwabara.Keiko teve a idéia de ir ao cinema com os dois, mas os dois não estavam com a minima vontade e inventam uma desculpa esfarrapada para sair dessa enrascada.Yusuke percebe que estavam sendo perseguidos por 6 homens, e brigam com eles. Yusuke usa sua mais nova arma o Shotgun, derrubando todos de uma vez. Botan aparece e diz a Yusuke que eles foram atacados por um inseto que é controlado pela flauta que esta em poder dos 4 monstros do inferno,que estão presos em seu castelo por uma barrera espiritual. Botan também diz a Yusuke que ele deve ir ao castelo e destruir a flauta. Botan leva-os a um lugar onde está a entrada do mundo dos monstros. Ela fica na Terra para destruir os insetos enquanto Yusuke e Kuwabara entram no mundo das trevas.Quando chegaram lá, eles lutam com alguns espíritos, eles estavam em desvantagem, mas de repente Kurama e Hiei aparecem para salva-los. Os quatro entram no castelo e encontram um olho voador que arma uma armadilha para eles. O teto começa a cair em cima deles, o olho diz que eles só se salvarão se um deles trair os demais.Yusuke diz para Hiei sair de lá e puxar a alavanca porque ele é o mais rápido de todos, assim daria tempo de salvar todos. Hiei pensa em trai-los e sair ileso de tudo isso, mas desde a primeira vez que eles se encontraram Hiei mudou muito e passou a confiar mais em Yusuke. Hiei salva os quatros e vão ao encontro do primeiro monstro:Guenmu.Kurama resolve lutar contra Guenmu. Kurama começa se defendendo dos golpes de Guenmu, mas depois resolve usar o seu golpe "RoseWhip", um chicote cheio de espinhos. Kurama destroi Guenmu muitas vezes, mas após ser destruido ele se recompoem. Kurama percebe que uma pedra vermelha, que faz parte do corpo de Guenmu, é o “cérebro” do corpo inteiro. Então Kurama destrói a pedra com o seu chicote matando Guenmu. Os quatro continuam a sua busca à flauta que salvará as pessoas. Eles encontram o segundo monstro:Yako. Kuwabara decide enfrentar esse monstro(Yako parece um Gato). Yako faz aparecer seus filhotes que arranham totalmente Kuwabara. Kuwabara vai até a ponte estreita e atingem os 4 monstros de Yako de uma só vez. Yako fala a Kuwabara que seus filhotes não são fracos. Kuwabara sai correndo envolta do pilar e amarra os montros no pilar. Depois é a hora de enfrentar Yako. Kuwabara usa a sua espada Leiquen para ataca-lo. Mas Yako absorve toda a energia de Kuwabara. Após muito tempo Kuwabara percebe que Yako está quase estourando de tanta energia que ele armazenou. Então, Kuwabara dispara mais uma vez o seu Leiquen, Yako armazena a energia e começa a sofrer de indigestão e cai do castelo. Eles então prosseguem em direção ao topo do castelo mas eles se encontram num lugar inundado de lava. Lá eles também encontram Yako que não havia morrido. Kuwabara enfrenta Yako novamente. Yako usa o seu golpe que quase destrói os pilares nos quais ele está pisando.Kuwabara da um soco em Yako que cai na lava. Agora só faltam mais dois monstros para serem destruidos. Eles encontram Seryu, o monstro do gelo. Hiei é o próximo a lutar. Mas de repente Yako (de novo!) aparece pedindo perdão, mas seryu resolve mata-lo. A luta entre Hiei e Seryu começa. Seryu congela os braços e a perna de Hiei. Mas Hiei, com a sua rapidez, mata Seryu com a sua espada. O último desafio de Yusuke e sua turma é o poderoso Suzako. Suzako manda as pessoas que foram dominadas pelos insetos procurarem Keiko e a matarem. Keiko encontra Botan que a ajuda a fugir das pessoas.Enquanto isso Yusuke enfrenta Suzako.Ele dispara seu Leigan contra Suzako,que rebate com a flauta. Suzako aproveita e invoca seu trovão das trevas, que acerta Yusuke. Yusuke vê que não ira conseguir se defender contra este poderoso ataque e coloca seus sapatos em suas mãos. Suzako ataca novamente, mas Yusuke barra com seus sapatos a energia do trovão, e soca a cara de Susako. Suzako decide se multiplicar e ataca Yusuke com o seu outro golpe o "super trovão das trevas", e Yusuke fica muito ferido. Um dos Suzakos senta na cadeira enquanto 2 seguram Yusuke 4 ficam de pé.Yusuke fica preocupado com Keiko, mas ao mesmo tempo lembra do treinamento de Genkai. Ela consegue encorajar Yusuke que derruba todos com a sua poderosa energia. Suzako fica fraco e reune todos os Suzakos em um só. Suzako conseguiu ficar com toda sua energia devolta e lhe diz que para vencer ele, Yusuke teria que atingir mortalmente todos os Susakos. Susako se multiplica de novamente. Todos os Susakos dispararam o super trovão das trevas e Yusuke ve Keiko em risco de vida e manifesta a energia da vida salvando-a e dispara seu Shotgun contra os Susakos que também dispararam seus trovões. O Shotgun de Yusuke acaba com os trovões dos Susakos e vence todos de uma vez, destruindo a flauta, e o passarinho de Susako.Enquanto isso Hiei, Kurama e Kuwabara chegaram no local onde ocorreu a ardua batalha.Eles vem que Yusuke esta sem energia. Kuwabara da parte de sua energia a Yusuke para ele não morrer. Quando Yusuke acorda depois da batalha, Kuwabara lhe diz que dormiu durante 3 dias. Yusuke pergunta como estava Keiko e Botan e ele faz uma cara triste. Mas as 2 aparecem ilesas, e Yusuke fica com uma cara de bobo. Quando Yusuke e Keiko ficam sozinhos, ela pede para ele prometer que quando tiver uma missão, a primeira saber seria ela. O Resgate de Yukina Yusuke volta a sua vida normal, quando recebe uma fita cassete de Hiei. Yusuke vai a escola e fala para Kuwabara que recebeu uma fita cassete do mundo espiritual e pergunta se ele não quer vera fita. Kuwabara não aceita, mas com tanta pressão eles vão ver na casa de Kuwabara. A fita continha a missão deles. A missão era invadir a mansão do senhor Tarukani e salvar uma jovem moça chamada Yukina. Quando Kuwabara viu a cara de Yukina, ele se apaixonou doentemente, e foi correndo atras dela. Quando Botan, Yusuke e Kuwabara chegaram na região, um segurança mandou eles irem embora, mas como eles não foram, ele se transformou num monstro que foi rapidamente morto,por Kuwabara e Yusuke. Yusuke falou a Botan que Kuwabara não viu toda a fita, por isso não teria como dizer-lhe que Yukina era irmã de Hiei. Tarukani tinha seus planos. Contratou os poderosos irmãos Toguro, testou-os para ver se eram fortes o bastante, e aposta com o seus amigos, quem iria vencer. Enquanto isso, Yusuke e Kuwabara vão vencendo todos os monstros que aparecem e Tarukani perde o seu dinheiro para o senhor Saki.Quando Yusuke, Kuwabara e Botan entram na mansão, eles devem enfrentar os 3 monstros da organização. O primeiro monstro foi derrotado facilmente por Yusuke, pois ele verificou que os seios dela era de silicone. Yusuke meio assanhadinho vai ver o que tem embaixo da calcinha do monstro e leva uma vassourada de Botan.O segundo monstro era rapido, e desaparecia. Quando Yusuke, Kuwabara e Botan sairam correndo e viraram a esquerda no corredor, o monstro foi atras e não esperava que Yusuke estava preparado para soltar o seu Shotgun, quando Kuwabara avisasse-o, e assim o segundo monstro foi derrotado.O terceiro monstro conseguiu pegar Botan, e Yusuke não conseguiria atirar o seu Leigan contra o monstro se não iria atingir a Botan. Quando Kuwabara foi atacar com a sua espada Leiquen, o monstro conseguiu fazer a espada desaparecer porque Kuwabara estava se concentrando em Botan. Yusuke percebe que o monstro estava segurando Botan pela Jaqueta, e pede para ela levantar os braços. Botan caiu e Yusuke e Kuwabara aproveitam a chance e dão um chute poderosissimo na cara do terceiro monstro. Assim Yusuke e sua turma vencem os 3 da organização. Kuwabara tenta se comunicar com Yukina e consegue. Agora Yusuke e Kuwabara terão de enfrentar os irmãos Toguro. Toguro Ototo aumenta seus musculos e o pequeno Toguro Ani se transforma numa espada. Kuwabara ataca com sua Leiquen, mas não da em nada. Mesmo o Leigan e o Shotgun de Yusuke não surtem efeito em Toguro.Todos estavam muito machucados, pois Toguro é muito forte. Kuwabara tem a idéia de Yusuke atirar o Leigan em suas costas e Kuwabara, com sua espada, cravar na sua barriga. Eles tentam isso, e funciona, Toguro Ototo caiu "morto" no chão.